Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
E2f6O54917 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f6O54917 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms