Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
DffaO54786 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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DffaO54786 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
DffaO54786 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
DffaO54786 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms