Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
EdaO54693 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
EdaO54693 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EdaO54693 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms