Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
FxnO35943 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FxnO35943 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FxnO35943 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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FxnO35943 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
FxnO35943 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
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