Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cops5O35864 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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