Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ptch2O35595 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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