Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Dgcr6O35347 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Dgcr6O35347 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms