Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pitx3O35160 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms