Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcm2O09102 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcm2O09102 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcm2O09102 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gcm2O09102 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gcm2O09102 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gcm2O09102 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms