Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Eftud2O08810 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms