Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
MsmbO08540 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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