Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp35M0QWN7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp35M0QWN7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms