Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr1288-201ENSMUST00000104889 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Gm15238-201ENSMUST00000119938 1296 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm16357-201ENSMUST00000144091 474 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Rnmt-202ENSMUST00000025427 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Akap14-201ENSMUST00000046557 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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Gm21887J3QQ04 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Ube2q1-202ENSMUST00000196726 1650 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Gm15071-201ENSMUST00000118189 1366 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Gm21887J3QQ04 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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