Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm2056J3QQ02 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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