Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm21900J3QP38 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21900J3QP38 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21900J3QP38 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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