Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc180J3QNE4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc180J3QNE4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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