Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Gm6176J3QK59 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms