Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm20517G3UVU6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm20517G3UVU6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms