Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srp72F8VQC1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srp72F8VQC1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms