Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm5798F7BTS7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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