Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm28048F7BCN0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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Gm28048F7BCN0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm28048F7BCN0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm28048F7BCN0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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