Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10378F6XQQ1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms