Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Crocc2F6XLV1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Crocc2F6XLV1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms