Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm5861F6VCN9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm5861F6VCN9 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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