Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Gm21977F6U3N7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm21977F6U3N7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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