Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Svs3aF2Z472 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Svs3aF2Z472 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms