Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn2r56E9Q4U5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms