Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fndc1E9Q043 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Fndc1E9Q043 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms