Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc8E9PWG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc8E9PWG2 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms