Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gimd1E9PW74 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms