Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cttnbp2B9EJA2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cttnbp2B9EJA2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms