Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20547B8JJN0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20547B8JJN0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20547B8JJN0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gm20547B8JJN0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm20547B8JJN0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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