Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf11cB4XVP9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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