Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms