Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brpf1B2RRD7 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms