Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Phf3B2RQG2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Phf3B2RQG2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms