Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Brpf3B2KF05 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms