Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Trabd2bB1ATG9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trabd2bB1ATG9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms