Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
H2al1jA2BFR3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms