Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms