Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Tubb1A2AQ07 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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