Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Scn1aA2APX8 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Scn1aA2APX8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms