Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ttll9A2APC3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms