Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Frmpd1A2AKB4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Frmpd1A2AKB4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms