Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm17043-201ENSMUST00000164621 1283 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm38047-201ENSMUST00000193690 1133 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Platr25-206ENSMUST00000222303 1171 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm20754-202ENSMUST00000192642 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm37126-201ENSMUST00000195289 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3238W4VSP7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms