Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Knop1Q9Z2Q2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Knop1Q9Z2Q2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms