Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Mbd1Q9Z2E2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Mbd1Q9Z2E2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms