Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Cldn6Q9Z262 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn6Q9Z262 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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