Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uso1Q9Z1Z0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms