Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn13Q9Z0S4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms